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自然主义的“新”在于重新发现中国道家自然哲学的真义，以佛家的自性论和缘起说圆成自然哲学。
“新自然主义”试图超越一神教创造神的独裁，还至高者无为而任自性无所不为的神圣母亲之真如本性。“新自然主义”廓清东方梵学、道学消泯自性的迷雾，认定自性本然与如来藏道体不二而二、非一而和的玄妙权能，为自我创造性确立根本道场。直探自性本源，穷究万物始基，确认人道在十法界的殊胜地位，践履个体生命于安立中求超越的从容中道，据此统摄西方的自由主义精神和中国儒家的中庸理性。万有并张，自他圆融，自达达人，以至于太和。
1 自本自根——自性道体
一切生命个体(佛家称为有情众生)的根本在自性如来藏不二的“圆觉妙明体”——道体。道
体即一即多、非一非多，可称之为“玄藏”。非存在(无)与存在(有)同出于道体，可称道为“玄门”，本自无生而生化万有。道体即一即多的关系蕴藏着一多互动的“虚机”、“潜能”。虚机待用，潜能待显，道体绝待无为而具无量妙用，不可以说无，不可以说有，非动非静，可动可静。自性灵明，觉照无碍，觉体不二，无对无余，是为圆觉。道体无来无去，而万有从之而来，是为“如来藏”。圆觉即是道体，道体不异圆觉，合称之“圆觉妙明体”、“自性如来藏”。“圆觉妙明体”表用，“自性如来藏”表体。因势待用，势者，一多相即之态。虚机待乘，乘则有道。体用不二，全用即体，全体成用，“独立而不改，周行而不殆”（老子），可称之为天地万有的神圣母亲。
神者，妙用无竭；圣者，本无仪态而仪态万方。
不可以智知，知则有对；不可以识识，识则是二。圆觉则无用，无用而无不用也。迷失圆觉则“应所知量，循业发现”，取用各别。不二无对，妙一真常，是为一真法界。一真法界，无诸对待，一、真、法界本无，但有假名，“道可道，非常道”（老子）。自性根本，超绝名相，玄默证会，方知究竟。
2 自然自化——大用流行
自性本来无性，以如来藏空性为性。空性者，无愿无相、无起无作。自性本空，而自性圆觉不空，藏诸智慧德相。德相者，于空性无相中出生无量性相。圆觉妙明，与如来藏妙合不二。因不二中即一即多，道体本具不二而二的潜构虚机。虚机待乘，为自性念动所乘；潜构待别，自性元觉了了分别。自性圆觉是绝待的大圆镜智，忽尔念动，智转为识，有对成别，是为自性元觉(于元觉之圆觉中念动起觉)，所觉为体，觉者为自，不二的道体为自别为虚无之身、无极之体。元觉即是种子识(佛家所谓阿赖耶识)，能化生一切法，成办一切业。
自性为什么要一念忽动?这是道体的潜构虚机自己应然，这是自性觉性的自己使然，是为自然而然，没有另外的推动者。本来如是，率尔自然。
道体中的自性是无量的，一起俱起，一动俱动，因为自性本来同体，觉性本来遍圆。最初念动的自性元觉由于根本无明（丧失圆觉妙明），妄认自我为独一神，错认余者（继之而起的自性和为自了别的无极之体）为独一神我念想所生。
佛家是持生命多元同体论的，与一神教及别种宗教哲学迥然不同。由于根本无明，要么持“神我论”，要么持“同体一元论”、“二元论”。
依佛家的自性缘起说，所谓“性空缘起，缘起性空”，第一缘起乃是如来藏法尔如是，自性元觉自觉使然，不可致诘，唯转识成智的大觉者能证知。在没有证知之前，我们只能说是“如是我闻”的第一假设。
“道法自然”就是第一假设。在胜义上是指道体一多相即的潜构势用，“法尔如是”，在第二义上是指各别自性所行之道是“自己使然”。
自性元觉与无极之身体相互扰动，念动则扰，扰则其他自性元觉继之而起念。无极之体由于自性元觉的了别已经是第二义的体，丧失了道体的圆满妙明。元觉与无极相互摩荡，风大（混沌），水大（混沌之流动状）相续生起。自性元觉依念起想，于混沌中开天辟地。天（乾）地（坤）是元觉与混沌交互为用的两种势用，一翕（抟）一辟（搏），一蕴（运）、一缴（化）。这两种势用相对相关、相反相成。以坤成相，以乾化裁，自性元觉运用这每种势用产生了两种权能：曰阴曰阳。势用是虚态的表述，权能是实态的表述。元觉与混沌相互为用、相资成形，辗转成诸世界相、诸众生相，元觉隐而念想生，混沌开而天地万物出。自性念想各别造业各异，递相演化为九种世界和众生。佛家的创世论是否定独一的主宰神的，也是否定一切外在于自性个体生命的"他生论"的。全法界皆是自性自然、自生自化的创作，皆是如来藏无量德相为自性所用的大用流行。
3 自裁自成、自感自通——创造权能、超越权能
自性个体依念想运化混沌，开天辟地，裁成世界和生命的性德体相。由于昧失圆觉妙明，众生权能偏执，自持自是，随业流转，主权沦丧。但人觉性未泯，主权未亡，一面循业受报，一面又于偏执有碍中奋求自由权能，从而开出多种理性道术，打通多种超觉玄门。
举要言之。人类的理性道术可分为三类：罗高理性(泛化的逻辑理性)、瑜珈理性、中和理性。人类的超觉玄门可分为三门：神启、通灵、直觉。罗高理性成就了人类向外扩张的创造权能，瑜伽理性成就了人类调控自我身心的神通妙术，中和理性成就了人类与自然、社会、人伦和谐共存的仁道理想。神启成就了宗教，通灵成就了巫术，直觉成就了神秘主义者。
4 自由自在——破限无碍
于人道得自由（自主自成），于人的世界得自在（自适自宜），这是人类追求创造性和谐之人道理想。人类运用科技、组织（制度秩序）、道德（宗教）、艺术，开创了生存、进化之路。
于神界待超升，乃至于十法界得自由自在，这是人类的超人理想。人类运用瑜伽、神启、通灵、直觉等手段，实践着超越、圆满之途，这是人类的另一种进化道术。
自由是动态的创造性的自我实现，自在是静态的和谐的自我实现。自由自在是互约共成的，是要与"他者"交互为约、依愿随缘才能成就的。
自由之路是难行的，自在之境是难得的。自性一念动后，因为根本无明遮蔽了圆觉妙明，其自由权能已经非圆不遍。自性依念成体，因想作业，攀缘受制：具体的个体生命是有执有碍的。自性的第一个创世事件就是有执有碍的，继之展开的生命世界其自由权能随着层级的降低而递减。依佛家看来，人道以下的生命世界其自由权能已经丧失，只是靠蒙昧的本能循业受报，不能自主，也无自主意识。人道因为自由意志特别强大，欲望尤其无边，而权能非常有限，不安份、不自在的状态是普遍的，由此展开的求自在争自由的旅程是极其悲壮的。
自由意志的无度扩张是危险的。虽然在第一义上，佛家是主张“心生则种种法生的”，但众生的心是昧失不明的，人类的念想意志只具本心（也即圆觉自性）的少分权能。而且，一世界一事物在众生共业所感现所造作之后有相对的独立性，有其相对的演化的自然律则，这种第二义的自然事物（也即相对的客观世界）有不再依人类后起的自由意志为转移的相对稳定性顽固性。人类在客观世界中的作业是受到自然律则的制约的，也受到人类社会的相互制肘，因而人在此世界的自由权能的开显，是缘合（因缘和合）顺道（人类世界万事万物相对独立而不改的运化律则）才能成就的。人类的确是可以越来越自由越来越自在的，如果人能顺道随缘而创化。究极的大自由大自在，是只有当人觉悟、顺应神圣母亲的道德（无为而无不为的第一义道德），勇猛精进、悲智双运，才可渐次成就的。
5 自圆自神——圆成自性
自性本与如来藏不二，本来共享着神圣母亲的圆觉妙明，由于念动业转，执持成碍。破除重重限碍，重新寻得大圆满、大自在，是一切众生或自觉或隐秘的终极冲动。
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